Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC80Q76M96 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC80Q76M96 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms