Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC129Q6ZRS4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC129Q6ZRS4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC129Q6ZRS4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC129Q6ZRS4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC129Q6ZRS4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms