Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ASCL4Q6XD76 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms