Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINGO4Q6UY18 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINGO4Q6UY18 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms