Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETMD1Q6P1Q0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms