Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
REEP3Q6NUK4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
REEP3Q6NUK4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms