Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KRT80Q6KB66 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms