Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CARMIL2Q6F5E8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CARMIL2Q6F5E8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms