Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG16L1Q676U5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms