Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZKSCAN2Q63HK3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms