Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RSBN1Q5VWQ0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RSBN1Q5VWQ0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms