Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PERM1Q5SV97 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms