Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SAPCD1Q5SSQ6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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SAPCD1Q5SSQ6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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