Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL12Q53G59 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms