Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF8Q3BBV2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NBPF8Q3BBV2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms