Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UVSSAQ2YD98 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms