Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SKIDA1Q1XH10 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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