Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL24A1Q17RW2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
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