Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PTPRNQ16849 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPRNQ16849 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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