Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ME3Q16798 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ME3Q16798 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ME3Q16798 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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ME3Q16798 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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ME3Q16798 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ME3Q16798 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ME3Q16798 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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