Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NTRK2Q16620 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms