Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SSX1Q16384 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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