Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PMCHL1Q16048 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PMCHL1Q16048 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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