Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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