Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPTX1Q15818 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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