Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALX1Q15699 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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ALX1Q15699 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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ALX1Q15699 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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