Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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