Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3CQ15386 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.33■■□□□ 1
UBE3CQ15386 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3CQ15386 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3CQ15386 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE3CQ15386 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE3CQ15386 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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