Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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