Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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PDCD1Q15116 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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