Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLD3Q15054 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms