Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IHHQ14623 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IHHQ14623 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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