Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSHL1Q14406 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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