Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM25Q14258 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRIM25Q14258 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms