Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SPIDRQ14159 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPIDRQ14159 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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