Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
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