Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHROOM2Q13796 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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SHROOM2Q13796 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHROOM2Q13796 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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