Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCIRG1Q13488 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCIRG1Q13488 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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