Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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