Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TARBP1Q13395 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TARBP1Q13395 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms