Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3FQ13275 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3FQ13275 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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