Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms