Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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GRIK3Q13003 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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