Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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STX4Q12846 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
STX4Q12846 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
STX4Q12846 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
STX4Q12846 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
STX4Q12846 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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STX4Q12846 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
STX4Q12846 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
STX4Q12846 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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