Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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