Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FMODQ06828 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FMODQ06828 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms