Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms