Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms