Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms