Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms